我国农村畜禽养殖发展方式粗放，资源消耗高、浪费大，畜禽粪便还田比例低，环境污染较为严重，其COD排放量是工业和生活污水COD排放量的5倍以上。对此，笔者提出农村畜禽养殖污染防治的一些思路。
一是加大对农村畜禽养殖环境保护的支持力度，增加资金投入。对示范村、先行村，建议采取“以奖代补”的方法，在畜牧用地、治理技术、工程资金方面应给予专项优惠政策；对原来污染突出但经过整治见到成效的地方，实行“以奖促治”；对按时完成治理目标、考核情况较好的地区，优先安排“以奖促治”资金。
二是加大农村环保宣传教育与培训力度。加强农村基层干部群众的环境知识培训，提升乡镇领导干部的环境保护意识。充分利用广播、电视、报刊、网络等各种载体，广泛宣传农村畜禽养殖环境保护知识，使畜禽粪便治理工作成为农村干部和农民群众的自觉行动。
三是严格环境准入政策，开展农村生态养殖示范创建活动。鼓励各乡镇积极创建环境优美乡镇、生态村，开展健康养殖示范场创建活动。畜牧产业区域布局按照生态农业发展的要求，进行统一规划，把畜牧场与农田、鱼塘、园地一并规划。在制订畜禽养殖环境保护规划时，对新、改、扩建的规模化畜禽养殖场严格执行环评和“三同时”制度，加大规模化畜禽养殖污染治理力度。划定禁养区和养殖小区，实行规模养殖场和养殖小区三级审查制度，对分散养殖户采取建设户用沼气池的方式治理养殖污染，对规模养殖场则按照土地耕种面积、地形条件确定养殖规模，规划相应的养殖小区。
四是推动环保机构向县以下延伸，逐步建立覆盖农村的环境管理组织体系。充实农村环境保护力量，保证必要的监测、执法装备、经费等工作条件，完善农村环境监测体系，建立健全环境监测指标体系和信息系统，加强对农村饮用水水源地保护区、规模化畜禽养殖场的环境监测；加大农村环境监督执法力度，对重点养殖户做到每周一查，其他养殖户至少一月一查，提升应对畜禽污染突发事件的快速反应能力。