甜玉米主要病害有大、小斑病，纹枯病，锈病等。病害以防为主，保持垄面干燥，轮作较好。在甜玉米株高70-80cm时，可使用石灰粉进行玉米病害的防治，用量约每亩20斤石灰粉。

　　大、小斑病：在抽雄前，可用10%“世高”水分散颗粒粉剂1000-1500倍，“世俊”40%悬浮剂3000倍，80%代森锰锌可湿粉剂500倍药预防；发病初期应及时施药防治，可用“世浩”10%苯醚甲环唑1000倍，25%必扑尔（敌力脱）乳油1000倍，每7-10天喷施一次，连续2-3次。

　　纹枯病：在发病初期用5%井冈霉素1000倍喷洒穗部及叶鞘叶片，每隔10天喷施一次，连续2-3次。重病田加施40%多硫悬浮剂500倍。

　　锈病：主要发生在秋季。在发病初期喷施25%三唑酮可湿粉剂1500倍或25%必扑尔（敌力脱）乳油1500倍、40%灭病威悬浮剂600倍，每隔10天喷施一次，连续2-3次。