根据史藉记载有关阿莲区发展沿革，可概括为明清时代、日治时代、光复以后三期：（一） 明清时代依近来的研究，阿莲区在汉人垦植前，应是原住民「塔佳里扬人」或「大杰巅社」的住地，或更早居于大岗山岩洞的「大岗山人」。这些先民长期在吾乡这片土地活动，留下些许足迹。直到荷兰时期，在大岗山下辟筑「王田陂」，阿莲区为荷属「阿姆斯特丹」农垦区部份领地。郑成功时期，阿莲区渐次有汉人移垦，大抵在二仁溪岸的中路、石案潭、青旗甲及近阿公店的九阄、土库，这些部落庄庙肇基约在同时。阿莲区郑氏时期属于万年县嘉祥里，清时属凤山县嘉祥外里。（二）日治时代本区日治初期隶属台南县，后归于凤山县阿公店厅，阿莲乡正式设治，大抵在大正九年（公元1920年），本乡隶属于高雄州冈山郡，名阿嗹庄，处理庄务的役场初设于庄长住宅，下辖有阿嗹、石案潭、中路、仑子顶、九阄、土库、冈山营七个大字。（三）光复以后战后，国民政府改设「阿莲区公所」，下辖十二街道，阿莲大致分为阿莲街道、清莲街道、和莲街道，后二者盖以清和宫命名，但习惯仍称之「阿莲三街道」。

民国六十七年，仑顶村因住户未满二百户，裁并入港后村。

民国七十一年，阿莲村因人口众多，分中正路以南地区另设「南莲街道」，故阿莲庄即今之「阿莲四街道」。