丰都，先秦时期，属巴国。

秦代，属巴郡枳县；西汉，属益州巴郡枳县；东汉初，置隶属益州巴郡；献帝初平元年至建安五年（190年-200年）隶属益州永宁郡。东汉和帝永元二年（90年），分枳县地置平都县，是为丰都建县之始。

三国时期，蜀汉延熙十七年（254年），平都县并入临江县，属益州巴郡。

西晋，属梁州巴郡；成汉，属荆州巴郡；东晋，属梁州巴郡。

南北朝时期，刘宋时属益州巴郡；南齐时属巴州巴郡；南梁时属楚州临江郡；西魏、北周时属临州临江郡。

隋朝，开皇三年（583年），属临州临江县；大业三年（607年）属巴东郡临江县；恭帝义宁二年（618年），自临江县分出置丰都县，隶临州。

唐代，贞观八年（634年），隶山南道忠州；天宝元年（742年），隶山南东道南宾郡；乾元元年（785年），隶山南东道忠州；至五代前蜀、后蜀，隶忠州。

宋朝，宋真宗时，隶夔州路忠州南宾郡；徽宗政和元年（年），复并入临江县；南宁高宗绍兴元年（1131年），丰都县复置；度宗咸淳元年（1265年），隶夔州路咸淳府。

元初隶四川行省重庆路忠州；至元二十一年（1284年），垫江县并入丰都；至正二十二年（1362年），明玉珍大夏政权时，垫江分出。

明朝，洪武十年（1377年），丰都县并入涪州，属四川承宣布政使司重庆府；十三年（1380年）自涪州（今涪陵）分出复置县，改名酆都，隶重庆府忠州。

清代，康熙十三年（1674年），酆都县为吴三桂军占领；十九年（1680年）清军复收；雍正十二年（1734年），隶忠州直隶州；嘉庆七年（1802年），隶川东道忠州直隶州。

民国元年（1912年），隶四川省忠州；民国2年（1913年），隶四川行政公署川东道；民国3年（1914年），隶四川巡按使公署东川道；民国17年（1928年），直隶四川省；民国24年（1935年），隶四川省第八行政督察区。

中华人民共和国建立后，1950年，隶西南区川东行署区涪陵专区；1952年9月，隶四川省涪陵专区；1958年县名酆都改为丰都；1968年至1995年，丰都县隶四川省涪陵地区；1996年设立地级涪陵市，丰都隶属涪陵市。

1997年12月，丰都县正式由重庆直辖市管辖。