仁和区境域，秦汉时已由中央政权所设郡县管辖。

两晋、隋唐、五代十国到宋、除属中央政权所设州县治理外，曾长期为南诏、大理等地方政权割据。

元朝，属云南行省黎溪、柏兴、北胜各州所辖。

明朝，分属四川省会川卫、盐井卫和云南省姚州、北胜州。

清朝，仍跨四川和云南两省，分属四川宁远府、云南楚雄府所辖州县。

民国废州、府，属四川省会理、盐边县和云南省大姚县（后析出永仁县）、华坏县。

中华人民共和国成立后，境域仍跨两省4县；会理县第八区（红格）；盐边县第五区（同德）、第六区（务本）；永仁县第三区（大田）、第四区（仁和）；华坪县三阳区。

1965年12月31日，将云南、四川两省4县划人的43个公社，建置大河、大田、金江、玉泉4个行政区；1973年2月，将四个行政区组建成东区、西区、郊区3个县级市辖区；1981年8月7日，郊区更名为仁和区。