莘庄自南宋至民国二年(1913)一直隶属于华亭县。

民国三年(1914)华亭、娄县两县合并为松江县后，莘庄隶属松江县。

民国三十五年(1946)划归上海市二十六区，翌年二十六区改名龙华区。

1949年5月15日莘庄解放，由松江县接管，设立莘庄乡人民政府，同年7月归属上海市龙华区。

1951年7月，莘庄乡分两乡(莘北、莘南)一镇(莘庄镇)。

1956年2月，两乡一镇又并为莘庄乡隶属西郊区。

1958年7月撤销西郊区，并入上海县。同年9月21日，成立七一人民公社，莘庄乡编为第三大队。

1961年8月，第三大队及第二大队部份地区从七一人民公社划出，组成莘庄人民公社。

1965年，建立莘庄城镇工作组。

1966年5月经国务院批准，莘庄镇为县属城镇，脱离公社，成立莘庄镇人民政府。

莘庄镇因跨莘溪而得名。莘庄地区在南朝（公元420－589年）已有墓葬，成陆年代当在六世纪以前。南宋度宗咸淳年间（1265-1274年），镇上已建有施水庵，俗称草庵。施水庵原在镇南南栅口以南约200米处，光绪三十四年（1908年）建筑沪杭铁路，南栅口外设莘庄车站，庵址首当其冲，经镇上绅商同意，旋将施水庵南迁1公里，与春申庵合并。现两庵均湮没，迄今已历七百多年。