耳口乡以耳口地片命名。解放前属上清区冷水乡和上清乡一部分。解放后属上清区冷水乡、圳上乡、耳口乡。

1952年为碧溪区耳口、港口、官桥、梅潭、圳上5个乡，1957年为耳口、官桥、梅潭、圳上5个高级社。

1958年成立耳口公社，1964年与泥湾公社合并为耳口公社，1965年泥湾、白庙、梅源三个大队划归上清公社所辖，1968年与冷水综合垦殖场合并为耳口公社、场。

1973年把冷水分出，属耳口公社。

1984年改乡。

1997年，面积160平方千米，人口1万，辖南港、耳口、梅潭、横港、圳上、菖莆6个行政村，乡政府驻大港下。