停止使用的房屋所占的土地不能免交城镇土地使用税。根据《中华人民共和国城镇土地使用税暂行条例》第三条的规定：土地使用税以纳税人实际占用的土地面积为计税依据，依照规定税额计算征收。而根据房产税的相关规定，房屋大修停用在半年以上的，在大修期间免征房产税。