存疑不起诉是可以撤案的。如果是检察院自己提出的案件，可以撤销，如果是公安局立的案件，检察院只能建议撤销，而不可以撤销。人民检察院作出不起诉决定的，应当制作不起诉决定书，公开宣布，并且应将不起诉决定书送到被不起诉人和他所在的单位。

一、存疑不起诉可以撤案吗？

存疑不起诉是可以撤案的。如果是检察院自己提出的案件，可以撤销，如果是公安局立的案件，检察院只能建议撤销，而不可以撤销。人民检察院作出不起诉决定的，应当制作不起诉决定书，公开宣布，并且应将不起诉决定书送到被不起诉人和他所在的单位。如果被不起诉人在押的，应当立即释放。不起诉决定在法律后果上属于无罪。

根据法律规定，人民检察院对案件作出不起诉决定，主要有以下几种情况：

1、人民检察院经审查后认为没有犯罪事实或者依法不应追究刑事责任的，应当作出不起诉的决定。

2、人民检察院对于退回补充侦查的案件，仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。

3、犯罪嫌疑人有刑事诉讼法规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。刑事诉讼法第十五条规定了以下几种情形：第一，情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的。第二，犯罪已过追诉时效期限的。第三，经特赦令免除刑罚的。第四，犯罪嫌疑人、被告人死亡的。第五，其他法律规定免予追究刑事责任的。

4、对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。

检察院在履职过程中发现的立案监督线索应及时移交侦监部门，形成监督合力;其次从调阅案卷中发现线索。

定期调阅公安机关的案卷材料，对公安机关已立案侦查的案件进行跟踪，发现不符合立案标准的案件，及时发出《要求说明立案理由通知书》，经审查不符合立案的，及时发出撤案建议。

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十五条规定有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：

1、情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;

2、犯罪已过追诉时效期限的;

3、经特赦令免除刑罚的;

4、依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的;

5、犯罪嫌疑人、被告人死亡的;

6、其他法律规定免予追究刑事责任的。

在现在法院判案的时候并不是由检察院举证说当事人有罪就会必然判定处罚的，必须是有绝对且不能反驳的证据存在且当事人也承认的情况下才能起诉的，如果检察院认为存在疑问就不起诉的话就应该认定当事人没有罪责，撤案的行为只是最后的一个程序而不是必要的。