感染性心内膜炎的具体发病率目前仍不清楚。因地域、种族、文化背景、生活习惯和经济状况的不同其发病情况有所不同。据统计，在发达国家本病的年发病率为（1.6%~6%）\/10万，国内对本病发病率尚缺乏准确的统计学数字，据文献报道，自各种有效抗生素广泛用于临床后，感染性心内膜炎的发病率明显降低；该病可见于任何年龄患者，儿童中发病率非常低而且婴儿中罕有发生，一般而言，年轻患者中女性较男性多见，50岁以上患者则是男性较女性多见。