玉米常见病有空秆、秃顶、缺粒等。空秆俗称“公子包谷”，是指玉米植株不结果穗或有果穗不能长大的现象。秃顶是指果穗顶部不结实的现象。缺粒有两种：一是果穗的一面有若干行由基部到顶部都不结实，俗称“半边包谷”，主要是花丝向一边下垂，影响正常授粉而形成半边无籽粒；二是满天星缺粒，即果穗上籽粒东一颗西一颗，俗称“癞子包谷”。
主要原因
品种特性瘦地若选用耐肥品种，会增大空秆率。一般马齿型品种、杂交种的秃顶度比硬粒型品种、地方种大。
种植密度过大玉米种植密度过大，植株过早封行，导致结果穗的功能叶片受荫蔽，光照不足，缺乏营养，植株个体发育差，雌穗分化受阻，这是形成空秆的主要原因。一般密度越大，空秆率就越高，据调查，亩植3500―4500株，空秆率为3―5%；亩植4500―5200株，空秆率为5―9%；亩植5500―6300株，其空秆率可达20%左右。同时因密度过大，叶片相互衔接而遮盖雌穗花丝，导致雌穗不能正常授粉而形成缺粒现象。
营养供应失调一是营养不足，空秆增加；二是氮、磷、钾比例配合不当，也增大空秆率。如果缺磷、缺钾，茎秆内糖分代谢受阻，致使茎秆内糖分增加而传输到雌穗的糖分相应减少，雌穗因营养恶化而不能发育成果穗形成空秆，所以空秆的味道也较甜。在花粉和雌穗形成发育期，如果养分、水分不足，特别是磷、钾缺乏，养分转运受阻，雌花形成遭到破坏，不孕花粉也增多，从而恶化受粉条件而引起秃顶、缺粒。
大、小苗不匀因种子质量差、播种过早、播种深浅及盖土厚薄不一致等原因，引起出苗不齐、不全，尤其是补苗或补种造成幼苗强弱差异，形成以大欺小、以强欺弱的不良群体结构，致使小苗、弱株不结实而形成空秆。
不良气候影响在玉米雌穗形成或发育时期若遇干旱，雌穗不能正常抽出或抽出不能吐丝，或抽出时间过晚，错过授粉期而形成空秆。
在雌穗分化期若遇连绵阴雨，一方面使土壤长期积水、通气不良，减弱根系的吸收能力；另一方面因光照不足，减弱光合作用，导致营养物质不足，不能进行雌穗的分化或分化后不能正常发育而形成空秆。在玉米抽雄前后，若土壤水分严重不足，导致雌雄不协调，当果穗顶部花丝抽出时，因花粉量不足而产生秃顶。在玉米开花期，若气温低于18摄氏度或高于38摄氏度，雄花不开放。温度在32摄氏度―35摄氏度、相对湿度仅30%时，花粉寿命短（1―2小时），同时花丝易干枯而引起秃顶、缺粒。
此外，病虫危害如玉米螟、丝黑穗病侵害果穗也易引起空秆；大风、大雨等极端异常天气对开花授粉也有极大影响而形成秃顶、缺粒。
防治途径
正确选用良种选用丰产潜力大、空秆率低的杂交种做到适期播种、因地种植。对自然条件差、气候变化大、土质脊薄的地区（块），宜选用耐脊适应性强的硬粒种或半马齿种；对肥水条件较好的地区（块），以选用马齿种为宜。
提高播种品质精细整地，采用肥团育苗，实行分级移栽，确保苗齐、苗全、苗壮。
改善群体内的光照条件
一要根据品种特性、土壤肥力及栽培水平实行合理密植，二要采取带状间、套种植，以改善群体的中上部光照条件。
加强肥水管理坚持“施足底肥，轻施苗肥，巧施秆肥，猛攻穗肥，酌施粒肥”的施肥原则，做到氮、磷、钾和有机与无机肥配施，以满足玉米各个生育时期对养分的全面需求。
及时灌溉和排水玉米大喇叭口期和吐丝期是需水的临界期，一旦遇旱应及时浇水，保持田间持水量达到70―80%，促进雌雄穗分化和雄穗花粉的形成和发育。同时，春玉米开花结实期正值雨季，暴雨等极端异常气候极易出现，遇涝还要及时排除积水，促进玉米的正常生长。
提倡人工辅助授粉和隔行去雄人工辅助授粉是满足雌穗所需花粉、减少秃顶、缺粒的一项有效措施。去雄可起到减少养分消耗、促进雌雄协调、减轻螟害和提高产量的作用，但遇连续阴雨或高温时，不宜去雄。