①适时降水。东北地区秋季天气晴朗，降水少，相对湿度小，9～11月之间玉米种子平衡水分在14%～15%之间。因此，在东北要抓紧9～10月所温尚高的时机，采用自然干燥方法，在严冬来临之前反玉米种子含水量降到临界水分以下。实践证明在东北地区玉米种子含水量降到14%～16%即可安全越冬。
首先，在玉米种子收获前实行站杆扒皮降低含水量。站杆扒皮的最适时机是蜡熟中期。一般在9月上中旬收获前10～20天进行。另外，玉米种子收获时，实行适时早收，高茬晾晒，适时早收的临界期是乳熟末期。以蜡熟期收获比较理想。高茬晾晒是将父本收获后，从地面上33cm左右割断，将母本行从地面割倒后扒捧绑挂，2或4个一吊，挂在父本行留茬上，进行田间通风。在玉米种子入仓前要将水分降到20%以下，从面做初步干燥。常用方法有立椿搭挂、木架吊挂、风干（棚内吊挂）和摊晒等。比较试验表明，以立椿搭挂为最好。该方法果穗在空间分布均匀，风吹日晒条件好，果穗向下，雨后积水少、干燥快、省材料，占地少，可广泛采用。其它方法可因地制宜选用。
②合理贮藏。玉米种子初步干燥后，贮藏时必须穗藏，因玉米穗藏孔隙度大便于进一步通风降水。用种最较大时可采用玉米楼贮藏。玉米楼采用秫桔或树条编成帘子围成长方形或圆形。其大小因种子数量和含水量而异。一般长3～4m，宽不过1.5～2m高2～3m圆仓直径3～4m左右。四周用方木作固定的主柱，在距地面1m处架好仓底，顶盖设人字架遮雨棚。
玉米入仓时应注意挑选，将成熟含水量高的果穗挑出来继续干燥，入仓种子含水量如果高于20%，应在7～10天后进行倒仓，将仓内处果穗互换位置，如果种子含水量在20%以下，一般不必倒仓，可一直贮藏到春季手足前脱粒。
用种量较少的农户。可在户内靠火山墙吊穗贮存。不要将果穗吊在靠近北墙，以阴谋诡计北墙上霜引起玉米种低温冻害。对引进已脱粒的种子还要进一步晾晒，晒干后用麻袋装好，放在火炕炕稍，并要定期翻动。不要随意改在室处或仓房贮存，以免一热一冷急剧变温，引起种子冻害，降低种子发芽能力。