低温会影响玉米根系对营养元素的吸收，尤其是对磷的吸收会受到阻碍。在生殖生长期遇到低温会使玉米的花器官不能正常发育从而导致花粉败育，最终影响授粉和结实。持续的低温还会造成玉米体内酶的合成受阻，从而影响光合作用和呼吸作用，最终导致生物积累的降低。
另外，突然的迅速降温会造成玉米失水萎蔫，最终死亡。在营养生长阶段若发生缺水，会造成玉米缺苗、密度不足、推迟成熟期、减产等。若在花器官发育期发生缺水，则会造成玉米花器官发育受阻，最终导致减产。生殖生长阶段发生缺水，就
会导致玉米严重减产。同样，土壤含水量和含盐量太高对玉米的生长发育也是极为不利的。