沼肥营养全面，肥效稳定，既可作追肥，又可作基肥，是一种很好的清洁有机肥料。此外，沼渣能提高地温和土壤的通透性，增强土壤的保肥、保水能力。用沼肥种稻，可以减少化肥用量，提高稻米品质。
1.秧田作底肥。水育秧，每667平方米苗床施沼渣1500kg作底肥；旱育秧，每667平方米苗床施沼渣1000kg做基肥，或苗床用沼液2～3kg/平方米，浇透苗床5cm土层，播种后，用喷雾器喷水，保持表土湿润，其它管理同普通育秧。
2.大田作基肥。翻耕时，每667平方米大田用沼渣1500kg和其它农家肥一道施入，翻耙整平田面，2天后即可抛（插）秧。
3.大田作追肥。抛（插）秧后5～7天，每667平方米施沼液1000kg，并加尿素7.5～10kg。晒田复水后，长势较差的田块每667平方米用沼液50kg和尿素0.5kg对水50kg喷施叶面，促壮秆。灌浆成熟期，每667平方米用沼液50kg加0.3%的磷酸二氢钾对水50kg喷施，促籽粒壮实。叶面喷施沼液可与化肥、农药混施，但要严格掌握浓度，防止灼伤叶片。