（1）合理轮作。应采用5年以上轮作，严禁重茬、迎茬。以玉米、小麦、谷子、大豆等作物轮作，是防治亚麻枯萎病的有效措施。

　　（2）加强栽培管理。同胡麻立枯病的防治。

　　（3）药剂拌种。用适量多菌灵加少量甲基托布津和代森锰锌制成复配药剂，用种子重量0.6%的药量拌种或用种子重量0.3%的炭疽福美拌种。

　　（4）选育高抗病优良品种和在无病田采种。选用抗病品种是防治枯萎病的一种有效方法。要在无病田中采种，无病地区应采取严格的检疫措施，防止带菌种子传播。

　　（5）喷药防治。发病初期喷洒64%杀毒矾可湿性粉剂800～1 000倍液或20%除锈灵乳油400～600倍液，每隔10天喷施1次，连续喷施2～3次。

　　（6）及时拔除田间病株，防止病原菌传播蔓延。