西藏自治区最大内流河。发源于唐古拉山岗盖拉西南的现代冰川末端，源头海拔5400米，全长480公里，总落差870米，平均坡降1.8‰。扎加藏布流域平均海拔5000米以上，且北高南低，东高西低，水系发育不对称，河谷走向受构造断裂控制，以东西向为主，间有南北向的转折，最后注入色林错。上段东西向，长约80公里，为宽谷盆地，冰碛物发育；中段河谷宽窄相间，长约170公里；下段长230公里，色林错附近沼泽发育。扎加藏布流域面积1.6675万平方公里，河水主要靠冰雪融水补给。据中国科学院青藏高原综合科学考察队1976年5月于中游中堡大桥附近测得水面宽98米，平均流速0.35米/秒，平均水深1.8米，流量约为61立方米/秒，矿化度为613毫克/升。扎加藏布地处高山草原地带，气候寒冷、干旱，年降水量少，湖泊星罗棋布，盐湖资源、野生动植物资源丰富，为纯牧区。