南朝梁大同三年（537），析宕渠县始置邻水县，属邻州邻山郡，县治在邻州城（今兴仁镇）。

西魏恭帝三年（556），属渠州邻山郡。

隋开皇元年（581），驻地由原邻州城移至岳池溪。三年（583），邻山郡入渠州。大业三年（607），改渠州为宕渠郡，邻水县属之。

唐武德元年（618），废宕渠郡复置渠州，改邻水县为潾水县，属渠州。是年，又分潾水、垫江县地置潾山、盐泉二县，设置潾州。二年（619），邻水县驻地由岳池溪移至昆楼镇。天宝元年（742），改渠州为潾山郡，仍辖潾水县。乾元元年（758），更潾山郡为渠州，仍辖潾水县。宝历元年（825），潾水县并入潾山县，大中元年（847），复置潾水县。

公元907年王建在成都称帝，复置邻州，仍辖潾水县。公元934年，改邻州为渠州，仍辖潾水县。

北宋乾德二年（964），宋太祖征服四川，改潾水县为邻水县，属渠州。元至元二十年（1283），邻水县因编户不足而并入大竹县，改名邻水镇。

明成化元年（1465），复置邻水县，属顺庆府（今南充市）广安州所辖，二年（1466），在今鼎屏镇建县治。

公元1644年，张献忠在成都称帝，定国号为大西。1646年，清灭大西政权。顺治十七年（1660）邻水县属川北道顺庆府。

民国元年（1912），废川北道，邻水县属顺庆府。

民国2年（1913），恢复川北道，邻水县属川北道顺庆府。

民国3年（1914），邻水县属嘉陵道（今阆中）。

1935年，川政统一，邻水县属四川省第十行政督察区（今大竹）。

1949年12月，成立邻水县人民政府，属川东行署区的大竹专区。

1953年3月，大竹专区撤销，邻水县改属川北行署区的达县专区（1968年改称地区）。

1993年7月，邻水县属广安地区。

1998年，广安撤地设市，邻水县属广安市。