明《肃镇华夷志》记载：河清堡，设在适中平川中地，土城周围二百五十丈。东北至盐池堡七十里，南至镇夷所属清水堡五十里，西南至金佛寺五十里，西北至临水堡七十里，北至双井堡六十里。内设防守官一员，军丁五十五名，马二十五匹，屯田一十顷七十九亩零，屯粮二百四十五石零，草三千九百二十束。所管沿路墩台五座，并无分管边埂水头。原系大路驿递，万历三十一年，驿所甲军七十七名，骡、牛四十五头只，改发双并堡。清《重修肃州志》记载：原有防守营，万历四十四年，尽将官兵调野麻湾堡，并作民堡，居民耕种。志书中言河清堡与其他堡城一样置于明初，但《酒泉史话》言“元朝为了发展中西交往开辟了驿运大道，设立驿站。仅酒泉一带就有高台、临水、盐池等十几个驿站，与驿站相辅的还有急递铺。”明朝建国初沿袭元朝驿运，元朝时下河清有从高台、盐池到酒泉的大路。所以应和其他重要驿站一样始建于元朝，只不过城堡规模要小于明朝。

从明《肃镇华夷志》、清《重修肃州志》、清《肃州新志》、《酒泉史话》可知：紫金城(河清堡)始建于元朝属肃州路管，是重要的驿站和递运所。明洪武年间置镇夷千户所，河清堡属之，清《重修肃州志》云：镇夷所，领镇夷、深沟、盐池、和清四驿、深沟、盐池、和清三递运所。万历三十一年，以地僻移驿于镇夷双井堡，万历四十四年，将剩余兵丁尽调野麻湾堡，此堡虽废为民堡。但仍然是高台、镇夷、盐池通往肃州的重要一站。雍正三年高台千户所和镇夷千户所合并为高台县，河清堡归高台管。雍正七年，因丰乐河、马营河上下游分属肃州、高台管，沿河人民常因浇水而起纷争，为管理方便，甘肃总督岳钟旗上书朝廷建议将高台所属下河清、马营、上盐池划归肃州管，将甘州之高台划归肃州直隶州管。

民国初，设有保甲局归肃州之清水管。

民国时属酒泉县的河东乡(区)管，治在清水。