明代属铁石乡在坊里南面的东山、石粉岭、蔡坑、黄庄，及上坪上社的崎濑等村落。清代至民国初，为东山社全境及马坑社、陈陂社的部分区域。

民国18年7月至民国21年间，成立马坑区苏维埃政府，辖崎濑、马坑等乡；成立东山区苏维埃政府，辖石粉、东山、董邦、浮塘、蔡坑、王庄、坑头等乡；成立山马区苏维埃政府，辖原东山、马坑；蕉坑区苏维埃政府，辖经畲、石钟（今属漳平）、中甲、黄田等乡；民国21年4月10日至10月27日，成立南福区苏维埃政府，驻地中甲。

民国22年，曹溪、莲山乡属西陈区，天和（崎濑）、东浮（蔡坑、月山）属第五区。次年属第一区。

民国26年3月，为第一区的曹溪、莲山乡联保，以及第二区的天和、东浮乡联保。

民国27年并为曹莲乡联保，辖10保。

民国30年12月包括曹莲乡的石庵、石盂、月山、曹圩、下寮、水塘、西中保；东安乡的马濑、王坑、东山、董邦、蔡坑、浮塘保。次年还包括从漳平县割入象和乡的中甲保。

民国33年后，辖区为曹莲乡的东山、王坑、董邦、后盂、水塘、下寮、西中、月山、蔡坑、马濑、浮塘、后张、石庵保，象和乡的中甲保及第二区的天和（4保）、东浮（5保）。

1949年11月，属西陈区，辖曹溪、月浮、石粉、山马、中甲村及双平村的坪尾。

1956年，属附城区，辖溪山、石粉、山马、中甲乡。

1957年分设溪山、中粉乡。

1958年，成立溪山公社、中粉公社。

1958年并入城关公社，设溪山、中粉管理区。

1959年属城郊公社。

1961年6月从城郊公社分出，分设曹溪公社，辖崎濑、马坑、王庄、浮蔡、月山、西洋、曹圩、下寮、水塘、黄坑、坪尾、董邦、东山、五星、石粉、坑头16生产大队、82生产小队及中甲公社的中甲、下经畲、黄洋、杨梅坪、毛桃坑、上进洋、柯松岭8大队、21小队。

1965年，二公社合并称曹溪公社。

1984年7月改设曹溪乡。

1987年，面积130.23千米，总人口22148人，其中非农业人口8211人，辖13村、93居民小组，乡政府驻地曹溪圩，距市区4千米。

1990年撤乡设镇。

1997年，面积130平方千米，人口2.4万，辖曹溪、下寮、西洋、水塘、坪尾、月山、浮蔡、坑头、王庄、崎濑、马坑、石粉、董邦、东山、黄坑、科桃、中甲、黄洋、经杨19个村委会。