良庆区历史悠久，秦以前属百越之地。公元前214年，秦王朝统一岭南地区后，设桂林、象、南海三郡，良庆区属桂林郡。

西汉元鼎六年（公元前111年），汉武帝重新统一岭南，良庆区地属郁林郡领方县所辖。三国时，属吴，后来又先后归西晋、东晋、宋、齐、梁、陈6个朝代管辖。

晋兴郡治设在晋兴县城，即今南宁。此为南宁良庆建制之始。隋文帝开皇十八年（公元598年），改晋兴县名为宣化县。隋炀帝改州为郡，归郁林郡。

唐武德四年（公元612年）改宣化县为南晋州（属岭南道）。贞观八年（公元634年），南晋州更名为邕州，设邕州下都督府。此为南宁简称“邕”之起源。唐天宝元年（公元742年），改邕州为朗宁郡。乾元元年（公元758年）复改朗宁郡为邕州。唐咸通三年（公元862年），分岭南道为东、西二道。岭南西道，治所在邕州（今南宁）。

后晋天福七年（公元942年），改邕州为诚州，仍归楚。后周广顺元年（公元951年）复名邕州，归属南汉。宋朝统一全国后，良庆区隶属于广南西路。

元朝至元十六年（公元1279年），属邕州路，元泰定元年（公元1324年），改邕州路为南宁路，至正二十三年（1363年），湖广行中书省分置广西行书省，良庆隶属广西行中书省。

明洪武元年（公元1368年），改南宁路为南宁府，即今南宁，隶属广西布政使司。清朝实行行省制，改布政使司为广西省，今良庆区为南宁府宣化县辖地。

2004年9月15日，国务院批准（国函[2004]79号）调整南宁市部分行政区划：设立南宁市良庆区。将原邕宁县的良庆、那马、那陈、大塘、南晓5个镇划归良庆区管辖，良庆区人民政府驻良庆镇。良庆区于2005年3月18日筹建，2005年4月30日正式挂牌成立。

良庆区始于2005年3月18日筹建，2005年4月30日正式挂牌成立。