检察院批捕两个月之后一般就会再继续侦查，从而可以依法的进入到审查起诉的阶段，最后就可以直接进入到审判的阶段；如果遇到证据不齐全的话，那么还可以对案件进行退侦，从而更好的处理。

一、检察院批捕两个月之后就会怎么处理？

批捕后继续侦查，一般两个月，之后案件移送检察院审查起诉，如果侦查终结会移送审查起诉，补充侦查两次为限，两次后仍然事实不清的，需要变更强制措施。一般的情况，两次后就到法院。

二、《刑事诉讼法》

第一百五十四条 对犯罪嫌疑人逮捕后的侦查羁押期限不得超过二个月。案情复杂、期限届满不能终结的案件，可以经上一级人民检察院批准延长一个月。

第一百五十五条 因为特殊原因，在较长时间内不宜交付审判的特别重大复杂的案件，由最高人民检察院报请全国人民代表大会常务委员会批准延期审理。

第一百五十六条 下列案件在本法第一百五十四条规定的期限届满不能侦查终结的，经省、自治区、直辖市人民检察院批准或者决定，可以延长二个月：

(一)交通十分不便的边远地区的重大复杂案件;

(二)重大的犯罪集团案件;

(三)流窜作案的重大复杂案件;

(四)犯罪涉及面广，取证困难的重大复杂案件。

第一百五十七条 对犯罪嫌疑人可能判处十年有期徒刑以上刑罚，依照本法第一百五十六条规定延长期限届满，仍不能侦查终结的，经省、自治区、直辖市人民检察院批准或者决定，可以再延长二个月。

三、法庭审理阶段的补充侦查

根据《刑事诉讼法解释》第二百二十六条第1款与第2款规定，合议庭在案件审理过程中，发现被告人可能有自首、立功等法定量刑情节，而起诉和移送的证据材料中没有这方面的证据材料的，应当通知人民检察院移送。审理期间，被告人提出新的立功线索的，法院可以建议人民检察院补充侦查。

根据《高检规则》第460规定，在法庭审理过程中，人民法院建议人民检察院补充侦查的，人民检察院应当审查有关理由，并做出是否补充侦查的决定。人民检察院不同意的，可以要求人民法院就起诉指控的犯罪事实依法作出裁判。

这里要注意，根据修改后的2018年最新《刑事诉讼法》，人民法院在法庭审理阶段没有了决定退回检察院补充侦查的权力，只能在“被告人提出新的立功线索”的情况下才可以提出建议。

综合上面所说的，批捕一起案件一般都是有法律的流程才能进行合法的办理，而且在处理的时候就会结合实际的情况来，只要证据全部齐全，那么就可以对案件进行判决，所以，在处理的时候都是执法人员也会把握好时间，从而更好的处理。