制种玉米苗期一般指出苗到拔节这一时期,是营养生长阶段。这一阶段的主要生长特点是生根和分化茎叶，地上部分生长缓慢，根系生长迅速。
玉米制种田的苗期管理不同于大田玉米。亲本种子比一般大田杂交玉米的种子自身生活力相对较弱，必须进行精细管理才能获得制种成功。苗期田间管理的中心任务是蹲苗促壮,培育壮苗、匀苗，达到苗全、苗色正、墩实、粗壮，使父母本正常生长,为花期良好相遇打下基础。
玉米制种田苗期管理的主要技术措施：
及时查苗、放苗、封洞，防止高温烧苗。制种田的缺苗一般不提倡补苗，因为补苗往往赶不上正常播种的苗，容易造成大苗欺小苗，生长不整齐，尤其会造成去雄不彻底现象，增加后期管理难度。如缺苗断垄较多，母本缺苗的切不可用其他玉米种子补种或补苗，也不能用原母本补种；父本缺苗的，可用原父本尽早补种（补种前可提前浸种）。
今年春季气温低、地温低，为促进根系下扎和幼苗生长，要多中耕、勤中耕，一般2-3次，最后一次中耕要结合培土进行，起到疏松土壤、提高地温、促进根系下扎，培育壮苗的作用。
早间、定苗。玉米制种田一般在3-4片真叶时间定苗。间苗是田间去杂去劣的第一个过程，定苗前根据双亲特性如叶色浓淡、叶形宽窄、叶鞘颜色、生长势强弱等特征拔除杂苗，但不能伤着苗。间苗时母本苗要留均匀一致的壮苗，父本留大、中、小苗，延长父本散粉时间。
防治苗期病虫害。播前经过包衣剂处理的种子一般不发生病虫害或发生较轻。玉米苗期虫害主要有地老虎和金针虫。要做好病虫害测报工作，一旦发现就要及时防治。
蹲苗。根据墒情进行蹲苗，干播湿出的地块如墒情较好不要再滴水，一般蹲苗45-50天，掌握“蹲黑不蹲黄、蹲肥不蹲瘦”的原则，但一般比大田进头水稍早，不能受旱。