1、选用抗病品种，目前较为抗病的品种有保玉七号、屯玉7号、云瑞7号、海禾14号、晴三、会单四号、滇丰4号、云瑞1号、云瑞2号、云瑞8号、路单10号、曲辰三号、海禾2号等。

　　2、收集病残体，烧毁或深埋并实行2—3年轮作。

　　3、选用包衣种。

　　4、加强田间管理，做到植株生长健壮，提高抗病力。及时防治玉米螟，因为玉米螟是穗粒腐病菌的侵染媒介。