（1）做好引种检疫，可从源头上杜绝病害传播。

　　（2）选种优良抗病品种，控制效果最好，最省钱。

　　（3）大力推广健康种苗。甘蔗长期用蔗茎做种，病原菌长期在蔗茎中累积，造成种性退化。温汤浸种和腋芽或茎尖离体培养获得的健康种苗基本不带毒，生长快，含糖分高。

　　（4）农业防治。拔除病株（黑穗病黑鞭）、轮作以及合理水肥管理，增强抗病能力。

　　（5）化学防治。除蔗种凤梨病药剂防治有效外，甘蔗生产上不提倡化学防治病害。