观赏鱼的疾病种类很多，一般将其分为两大类：一类主要由有生命的动物、植物或微生物引起，如由寄生虫、真菌、单细胞藻类、细菌及病毒等引起的疾病，成为生物性疾病。其中由寄生虫引起的鱼病称为观赏鱼寄生虫性疾病，包括单细胞原虫，其特点一般是发病和传播较慢，发病率和死亡率较低，防治也较容易。由真菌、细菌和病毒等引起的疾病，大多发病急、传播快、发病率和死亡率都比较高，有较强的传染性，故称之为观赏鱼传染性疾病，此类鱼病不易防治。寄生虫性疾病和传染性疾病统称为侵袭性鱼病或生物性鱼病。

另一类疾病称之为非生物性鱼病或生理性疾病，主要是由水体环境中的机械、物理、化学等非生物因素引起，或因鱼体生理机能失调所引起机体的代谢障碍或机能紊乱而导致，此类鱼病的种类很多，病因复杂，危害较大，涉及面也较广，如因缺氧而引起的“浮头”和“泛池”、工业或生活污水引起的鱼类中毒等。但无论是哪一类鱼病，只要加强管理，做好生物安全和综合预防工作，都可以完全避免其发生，若按疾病的临床症状和病程的长短，观赏鱼疾病又可分为急性型、慢性型和潜伏型三种类型。

急性型疾病是指观赏鱼在正常生活条件下，很快由生理性行为转化为病理性行为，其特点是发病急、死亡率高，病程迅速，有数天到1~2周，如由黏球菌引起的白头白嘴病，发病1~3天后即可使成千上万只鱼苗死亡；慢性型疾病则病程稍长，为2周至几个月、大多无死亡高峰，如慢性型鳃霉病；潜伏性疾病是指观赏鱼体内存在病原体，正常情况下体表不表现临床症状，但当周围环境发生改变导致鱼体抵抗力下降时，其体内的病原体开始大量繁殖，以致引起疾病的发生，因此加强饲养管理，提高鱼体的抗病能力，是预防和治疗这类疾病最为有效的方法。若按疾病侵害的部位来分，可将观赏鱼疾病分为局部性疾病和全身性疾病。局部性疾病是指病理变化主要仅限于身体的某一部分，如皮肤病、鳃病、肠道病、眼病、肌肉病、肝病、骨病、胆囊病、鳔病等；全身性疾病是指此类疾病影响到整个机体，如泛塘、中毒、饥饿、营养不良、败血症等。