永源镇原名永增源。从1909年建县到1945年“九一三“，这里均是巡警局、警察署和保甲所、村公所的驻地，是阿城县的重要粮食集散地。伪康德4年(1937年)，挖城壕、建炮台、开四门。

当时镇内有商铺23户，有住户220户、1263人。

1959年，公社机关在改建后的哈同公路北侧(原小街的西南)，建起办公室和俱乐部，之后供销社、旅店、饭店、铁木社、公路客运站、广播站、邮电所、银行营业所、中小学校和县营永源粮库、永源制油厂等单位，陆续在公路两测建房，新的中心街道长达2公里。

1985年，永源全镇住户达7710户、总人口3．62万人，其中农业人口3．47万人。 2006年8月15日，国务院批准（国函[2006]73号）：同意将阿城市永源镇、巨源镇划归哈尔滨市道外区管辖。同意撤销阿城市，设立哈尔滨市阿城区。以原阿城市（不包括永源镇、巨源镇）的行政区域为阿城区的行政区域。阿城区人民政府驻民权大街。