黑龙江南源。其上源为海拉尔河，由东往西流，至阿巴盖堆转向北流称额尔古纳河。海拉尔河与呼伦湖水系过去相通，1958年扎赉诺尔矿务局为避免海拉尔河洪水及呼伦湖高水位威胁，将湖北岸的木得那亚河堵死，隔断河湖水流。1965年在木得那亚河东侧另开新河导湖水入海拉尔河。额尔古纳河于流为中俄界河，左岸属俄罗斯，右岸属中国。

　　右岸沿途有根河、得耳布尔河、莫尔道嘎河、阿巴嘎河、贝尔茨河、乌玛达河、大司洛夫卡河等7条较大支流。额尔古纳河长900公里，上游阿巴盖堆至吉拉林河段，河谷由5～10公里渐变为2～3公里。吉拉林以下流进山谷中，河谷宽1公里左右，河道宽约200～300米，水深1.5米，比降0.38‰，水流平稳，河口年均流量40O立方米/秒。由于水量补给来源主要是降水，故季节变化明显，5月中旬冰雪解冻，出现一次高水位，7～8月出现最高水位。

　　额尔古纳河流域植被覆盖度较大，水土保持良好，河水清澈，合沙量小，鱼类繁多。河流全程虽可通航，但冬季严寒（冰期长达210天左右）期间不能航行。在初冻和解冻时期，每年形成两次冰坝，阻塞河水，常带来灾害。