晋源区原为南郊区，为古晋阳城所在地。

尧帝在此筑唐城，称为唐地。

夏、商、周时称唐国。西周初，周成王剪桐叶封弟叔虞为唐国诸侯，史称唐叔虞。

秦为太原郡治。

汉为韩国国都、代国国都、太原郡治、并州刺史部治所。

西晋为太原国都、太原郡治所。

十六国时为前赵、后赵、后燕郡州治所或国都。

北齐为大丞相府、别都、太原郡治。

隋为并州治、太原郡治，唐为北都、太原府治、北京。

五代为后唐西京，后汉国都。

宋及金、元、明、清、民国，境内县级建置基本稳定，先后称平晋县、太原县、晋源县。

抗日战争和解放战争时期，曾一度建立清（源）太（原）县、清（源）太（原）徐（沟）县民主政府。

太原解放后，初为晋源县，1951年8月划归太原市，撤县分置外六、外七两个区。之后，随着太原市行政区划的变动，境内所属的区、公社多次变动。

1970年3月，南郊区正式成立。

1996年，南郊区辖小店、北格、晋源、晋祠4个镇，金胜、姚村、刘家堡、西温庄、亲贤、黄陵、郝庄、杨家峪、孟家井9个乡，239个村委会，298个自然村，14个居民委员会。中共南郊区委、区人民政府驻小店镇昌盛西街49号。

1998年1月1日正式挂牌成立晋源区。