1955年6月，石城桥办事处成立。

1960年4月，石城桥与侯家桥办事处合并，成立建邺人民公社汉中门分社；水西门、止马营两个办事处合并，成立建邺人民公社汉中门分社；水西门、止马营两个办事处合并，成立建邺人民公社莫愁湖分社。

1961年10月，分别改称汉中门办事处、莫愁湖办事处。

1962年10月，莫愁湖办事处改称水西门办事处。

1968年4月，改称汉中门街道、水西门街道革命委员会。

1970年8月，汉中门街道革命委员会并入侯家桥街道革命委员会。

1978年10月，恢复汉中门办事处。

1987年4月，撤消水西门办事处，部分地区并入汉中门办事处，并改称莫愁湖街道办事处，位于建邺区境西北部，距区政府3千米。

1996年，面积3平方千米，人口3.7万人，辖迎春里、涌泉里、胜棋里、荷花里、郁金里、玉兰里、江叉里、海棠里、梅花里、西街头、下河街、牌坊街、凰凰街、凤西、凤凰新村、二村、三村、二道埂子南段、北段、茶花里、凤凰庄、茶西里、凤西中段23个居委会。

2002年10月，南京市区、街行政区划调整，整建制划归鼓楼区管辖。

2003年10月，更名为莫愁办事处，并将江东办事处所辖凤凰花园社区、教工新村社区整建制划入莫愁街道办事处。

2004年末，莫愁街道办事处驻涌泉里7号，面积4.59平方千米，人口52175人，辖莫愁新寓、凤凰街、凤凰西街、凤凰西街中段、凤凰新村、凤凰二村、凤凰三村、海棠里、凤凰花园、教工新村10个社区。

2009年5月，鼓楼区政府将江东街道蓝天园、白云园两个社区居委会整建制（东至外秦淮河河道中间线、南至龙园南路道路中间线、西至江东北路道路中间线、北至草场门大街道路中间线，总面积0.74平方千米，户籍数约0.6万户，人口数约1.96万人）划入莫愁街道办事处，莫愁街道同时因境内有凤凰街而更名为凤凰街道。

2009年5月，将江东街道的蓝天园、白云园2个社区整建制划入莫愁街道，