战国前为北方游牧民族活动地。战国时属赵国云中西界地区。西汉为咸阳、犊和两县。北魏为怀朔镇东南境。隋开皇四年(公元584年)置油云县。唐朝置云中守提使。辽金时为云内州辖地。明代，萨拉齐曾是阿拉坦汗统治的腹地。入清，实行“蒙民（民，指汉族人）分治”，渐成“旗厅并存”之制。蒙古族人主要是“五、六甲”之地，属归化城土默特右翼（旗），治所设在归化城，汉族有乾隆年间专设的萨拉齐厅管理，这样就形成了“一土二衙”的行政建制。在乾隆年间即设立的“口外五厅”中，以萨厅管辖面积为最大，东接今毕克齐，西括今之河套。入民国，萨拉齐厅改为县制。

1958年，土默特旗西扩，同时撤销萨拉齐县建制，萨拉齐县并入土默特旗，土默特旗人民委员会迁驻萨拉齐镇。

1965年，国务院撤销土默特旗建制，分设土默特右旗和土默特左旗。

1969年，土默特右旗和土默特左旗正式分开办公，土默特右旗革命委员会设于萨拉齐镇。

1971年，土默特右旗划归包头市。