禾云镇建制于1515年，因三水县两表兄——植禾峰、郑椅云最早迁居此地，取两人名各一字得“禾云”镇名。禾云镇属原清远县第15区，1958年设立红旗公社，1959年改名禾鱼公社，1961年又改名为禾云公社，1984年改设区，1986年建镇，2004年5月，原沙河镇（含原新洲镇）、鱼坝镇并入禾云镇。