早在距今一千三百多年前的唐朝贞观三年（公元629年），三都辖地就开始设置婆览县，即今恒丰、烂土一带；都尚县，即今都江一带，属应州管辖，州治在都尚县．应州刺史为当地的大姓豪族谢元深，宋代属塞州路绍庆府所辖五十六羁鹰州的南部东段边地。元朝至元二十六年（1289年），烂土洞长忽带以三百洞一百一十寨内附。至元二十八年十月（129年），将洞蛮烂土改建定云府，改陈蒙洞为陈蒙州，合江为合江州，属定云府管辖。至元二十九年正月，设陈蒙烂土军民安抚司。明洪武十九年（1368年），改都云定云安抚司为都匀安抚司。洪武二十四年

三都民庆活动

授张均为合江州陈蒙烂土长官司，隶都匀卫。弘治七年（1494年）五月，烂土长官司改属独山州。清雍正九年（1731年）七月，将来牛寨置都江厅，属都匀府管辖。雍正十二年（1734年），以烂土司地置三脚屯州同，隶独山州。

民国3年（1914年），将三脚屯州同置三合县，改都江厅为都江县。

民国30年（1941年）6月，三合、都江两县合并，改名三都县。

1941年并三合、都江二县置三都县，取二县首字命名。

2000年，三都水族自治县辖7个镇、14个乡。根据第五次人口普查数据：全县总人口297442人，其中各乡镇人口（人）： 三合镇 36875 大河镇 12129 普安镇 18322 都江镇 14995 中和镇 10441 周覃镇 14315 九阡镇 19745 拉揽乡 4406 丰乐乡 20124 烂土乡 17676 交梨乡 18345 坝街乡 9182 打鱼乡 10929 羊福乡 6519 巫不乡 4299 水龙乡 13578 塘州乡 16893 三洞乡 16902 廷牌乡 17681 恒丰乡 8686 扬拱乡 5400

2003年，三都水族自治县辖10个镇、11个乡，270个村委会和4个居委会。年末总人口32.59万人，其中，非农业人口1.72万人；少数民族人口30.47万人，占总人口的93.49%。少数民族人口中，水族人口20.29万人，占全县总人口的62.23%。