赤坭镇，因政府驻赤坭圩得名。

赤坭圩原名巴由圩，明末清初，赤坭镇境内成圩集，原址在巴江河石仔岗，因地狭小，不宜扩大，清道光年间迁至剑岭附近，因圩附近岗丘风化层土壤为赤红壤，以泥土赤红之义得名赤坭圩，镇因圩名。

清咸丰五年（1855年）称联平局。

民国元年（1911年）与炭步合并为花县第五区。

建国初，与炭步合称西区。

1952年为巴江人民公社。

1959年为赤坭人民公社。

1983年改为赤坭区。

1987年撤区建镇。