经过二十多年的发展和积累，我国已经初步建成了世界上为数不多的，包括功能基因克隆、遗传转化、品种选育、安全评价、产品开发、应用推广等各环节在内的转基因育种科技创新和产业发展体系，转基因作物研究开发的整体水平已领先于发展中国家，目前在转基因技术的研究与应用方面积累大量的知识产权，构建了水稻等作物染色体片段导入系文库和突变体文库，克隆了一批抗虫、抗病、抗除草剂、抗逆、优质、高产、养分高效利用等重要性状基因，并开展了育种价值评估，筛选出具有自主知识产权和重要育种价值的功能基因46个。截止到2010年底，在农业基因工程领域，我国受理相关专利申请2万余件，国内申请量占到57%。在酶工程、微生物发酵工程等领域，我国受理相关专利申请3万余件，国内申请量占到72%。