根据《财政部、国家税务总局、中国人民银行关于进一步加强代扣代收代征税款手续费管理的通知》（财行[2005]365号）第二条第一项关于“三代”税款手续费支付比例规定，法律、行政法规规定的代扣代缴、代收代缴税款，税务机关按代扣、代收税款的2%支付手续费。第六条第四项关于手续费支付管理规定，因“三代”单位和个人自己的原因，3年不到税务机关领取“三代”税款手续费的，税务机关将停止支付手续费。因此，上述单位只能申请退还自缴纳税款之日起3年内代扣代缴的个人所得税手续费，比例为税款的2%。