主要有：生态文明建设刚刚起步，经济总量偏小和整体素质薄弱的制约并存，统筹发展与保护难度较大；工业化的道路还很长，结构调整和转变经济发展方式的任务还很重，在发展对资源环境的刚性需求不断增长的同时，节能减排的压力较大；城市化水平较低，中心城市的建设力度和中心镇的培育力度有待加大，内聚外迁的进度有待加快，基础设施的共享程度有待提高；农村环保设施滞后，面源污染范围广，治理成本高；生产力布局、人口布局还不能完全适应生态功能区定位，亟需进一步优化，等等。