分居期间孩子抚养权应当是按照最有利于孩子健康的原则来进行判定。根据我们国家《民法典》第1084条当中明确的规定，父母和子女之间的关系并不会因为父母离婚而消除的。因此父母是对孩子有抚养义务的。

一、分居期间孩子抚养权怎么判定?

1、分居期间孩子抚养权应当是按照最有利于孩子健康的原则来进行判定。分居离婚小孩抚养权规定如果是不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则，判给女方;已满两周岁的子女，人民法院根据双方的实际情况，从有利于子女身心健康，保障子女的合法权益出发来判定抚养权的归属。

2、法律依据：《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条，

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。

二、离婚怎样得到孩子抚养权

离婚的到孩子抚养权的有利条件有：

1、2周岁之内的孩子，女方抚养优势大;

2、同等条件下，与孩子性别相同的一方得到抚养权的可能性较大;

3、同等条件下，父母一方收入较高或者生活条件较好的优势更大;

4、孩子选择跟随一方生活的基本会听从孩子的意愿。

在有利于保护子女利益的前提下，父母双方协议轮流抚养子女的可以进行轮流抚养。

由父母双方轮流抚养子女，一方面能够减少因父母离婚给子女心灵上投下的阴影，使子女不因父母离婚而失去父母的共同关怀爱护，在人格上、生理上健康成长;另一方面，由父母双方轮流抚养，也可以使不与子女共同生活的父母一方在感情上得到慰藉，可以缓和当事人双方的对立情绪，融洽双方的关系，共同做好对孩子的抚养教育。

在当代的社会夫妻感情确实已经破裂到当地的人民法院提起诉讼，并且在这过程当中夫妻双方已经分居了，那么孩子的抚养权还是需要由双方当事人协商，或者是由人民法院来进行判定的。但是不管怎么样，抚养权都需要按照最有利孩子健康成长的原则来确定的。