挪用资金罪单位是否进行起诉挪用资金的相关员工要根据公司的相关规章制度来进行判断，如果在规定的时间之内员工归还的请挪用资金的相关资金，那么用人单位可以决定不对员工进行起诉，只给予开除或者是相关的处罚。

挪用资金罪单位不起诉可以吗?

挪用资金，是否构成犯罪，要考虑到几个方面的因素：挪用的时间、用途、金额、是否归还。如果已构成犯罪，虽归还但司法机关仍然可以追究其刑事责任。如果情况不严重的，可以免于刑事处罚

《刑法》

第二百七十二条 【挪用资金罪】公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或者借贷给他人，数额较大、超过三个月未还的，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动的，或者进行非法活动的，处三年以下有期徒刑或者拘役;挪用本单位资金数额巨大的，或者数额较大不退还的，处三年以上十年以下有期徒刑。

国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员有前款行为的，依照本法第三百八十四条的规定定罪处罚。

法律规定：

1、最高人民法院《关于办理违反公司法受贿、侵占、挪用等刑事案件适用法律若干问题的解释》(1996.12.25 法发[1995]23号)

根据《决定》》第十一条规定，公司和其他企业的董事、监事、职工利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或者借贷给他人，数额较大、超过三个月未还的，或者虽未超过三个月，但数额较大，进行营利活动的，或者进行非法活动的，构成挪用资金罪。

实施《决定》第十一条规定的行为，挪用本单位资金一万元至三万元以上的，为“数额较大”，为进行非法活动，挪用本单位资金五千元至二万元以上的，追究刑事责任。

挪用本单位资金案发后，人民检察院起诉前不退还的，依照《决定》第十条的规定定罪处罚。

2、《刑法》第二百七十二条 公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或者借贷给他人，数额较大、超过三个月未还的，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动的，或者进行非法活动的，处三年以下有期徒刑或者拘役;挪用本单位资金数额巨大的，或者数额较大不退还的，处三年以上十年以下有期徒刑。

挪用资金罪的起诉权虽然是在司法部门，但是如果员工涉及的相关金额非常大再归还之后，用人单位也可以向司法部门进行报案由司法部门来对犯罪嫌疑人进行起诉，然后对其进行合法的相关判决。受到法律规定的相关处罚，承担相关的刑事责任。