主动投案批捕后反供，不认定是自首，自动投案是指犯罪事实未被司法机关发觉，尚未受到讯问，主动直接向公安机关、人民检察院或者人民法院投案，向其所在单位或者其他有关负责人员投案的，应当视为自动投案。

主动投案批捕后反供怎么办?

犯罪嫌疑人自动投案如实供述自己的罪行又翻供的不认定自首。

1、认定：

1.1自动投案，是指犯罪事实或者犯罪嫌疑人未被司法机关发觉，或者虽被发觉，但犯罪嫌疑人尚未受到讯问、未被采取强制措施时，主动、直接向公安机关、人民检察院或者人民法院投案。

1.2犯罪嫌疑人向其所在单位、城乡基层组织或者其他有关负责人员投案的;犯罪嫌疑人因病、伤或者为了减轻犯罪后果，委托他人先代为投案，或者先以信电投案的;罪行尚未被司法机关发觉，仅因形迹可疑，被有关组织或者司法机关盘问、教育后，主动交代自己的罪行的;犯罪后逃跑，在被通缉、追捕过程中，主动投案的;经查实确已准备去投案，或者正在投案途中，被公安机关捕获的，应当视为自动投案。

1.3并非出于犯罪嫌疑人主动，而是经亲友规劝、陪同投案的;公安机关通知犯罪嫌疑人的亲友，或者亲友主动报案后，将犯罪嫌疑人送去投案的，也应当视为自动投案。

1.4犯罪嫌疑人自动投案后又逃跑的，不能认定为自首。

2、如实供述罪行

2.1如实供述自己的罪行，是指犯罪嫌疑人自动投案后，如实交代自己的主要犯罪事实。

2.2犯有数罪的犯罪嫌疑人仅如实供述所犯数罪中部分犯罪的，只对如实供述部分犯罪的行为，认定为自首。

2.3共同犯罪案件中的犯罪嫌疑人，除如实供述自己的罪行，还应当供述所知的同案犯，主犯则应当供述所知其他同案犯的共同犯罪事实，才能认定为自首。

2.4犯罪嫌疑人自动投案并如实供述自己的罪行后又翻供的，不能认定为自首;但在一审判决前又能如实供述的，应当认定为自首。

综上所述，并非出于犯罪嫌疑人主动，经亲友规劝投案的，视为自动投案，自动投案后又逃跑的，不能认定为自首，自动投案后，如实交代犯罪事实，认定为自首。