仲裁中笔迹鉴定申请程序是：一方当事人提出申请、确定鉴定样本、选定鉴定机构、笔迹鉴定、重新鉴定等，对于笔迹鉴定的具体情况应当根据实际的诉讼案件情况来认定，避免法律适用错误的情况。

一、仲裁中笔迹鉴定申请程序是什么?

在举证期前向法院提起申请，申请方需提供鉴定的检材及对比样本(需经对方质证)，双方协商选定或摇号选定鉴定机构鉴定即可。具体程序如下：

1、由一方当事人在举证期前向法院提起申请;

2、经过双方当事人质证，确定提供鉴定的样本;

3、由双方协商选定或摇号选定鉴定机构;

4、鉴定机构接收后鉴定申诉后，凭借自己专业技术及依法做出鉴定意见;

5、双方当事收到鉴定意见后对鉴定结论有异议的，还可以申请重新鉴定。

注意：申请笔迹鉴定并不一定需要当事人双方都同意。

二、仲裁中笔迹鉴定申请的司法解释

根据《中华人民共和国民事诉讼法》：第七十六条：当事人可以就查明事实的专门性问题向人民法院申请鉴定。当事人申请鉴定的，由双方当事人协商确定具备资格的鉴定人;协商不成的，由人民法院指定。

当事人未申请鉴定，人民法院对专门性问题认为需要鉴定的，应当委托具备资格的鉴定人进行鉴定。

笔迹鉴定，是对人通过书写活动形成的字迹进行的鉴认、识别活动。人的书写习惯具有特定性和稳定性，并在笔迹中得到反映。通过对笔迹的检验，可判明文件中的笔迹由几个人所写，是否由某人所写，利用笔迹进行人身同一认定，证实文件的真伪。

鉴定时要了解案件有关情况，明确鉴定要求，査验笔迹物证和笔迹样本;分析判断笔迹是否正常，有无伪装或由于其他原因引起的变化;选择能反映书写人书写习惯的稳定的和带有特殊意义的特征;对检材和样本中找出的特征进行比较，找出符合点和差异点;对符合点和差异点的形成原因综合评断;做出鉴定结论并制做鉴定书。

笔迹鉴定作为司法机关合法的对证据进行审查的方式，可以按照以上程序来处理，但法律上也明确规定了笔迹鉴定的时间限制，当事人对笔迹鉴定的情况有异议的，可以申请重新鉴定，具体情况下由司法机关来进行合法的认定。