缺席判决笔迹鉴定的程序是：提出笔迹鉴定申请、提交检材、提交样本、鉴定部门鉴定、出具鉴定报告等，对于缺席判决的过程中，也是可以进行笔迹鉴定的，合法的鉴定结果是可以作为证据来使用的。

一、缺席判决笔迹鉴定的程序是什么?

1、由一方当事人在举证期前向法院提起申请;

2、经过双方当事人质证，确定提供鉴定的样本;

3、由双方协商选定或摇号选定鉴定机构;

4、鉴定机构接收后鉴定申诉后，凭借自己专业技术及依法做出鉴定意见;

5、双方当事收到鉴定意见后对鉴定结论有异议的，还可以申请重新鉴定。

二、司法解释

笔迹鉴定，是对人通过书写活动形成的字迹进行的鉴认、识别活动。人的书写习惯具有特定性和稳定性，并在笔迹中得到反映。通过对笔迹的检验，可判明文件中的笔迹由几个人所写，是否由某人所写，利用笔迹进行人身同一认定，证实文件的真伪。鉴定时要了解案件有关情况，明确鉴定要求，査验笔迹物证和笔迹样本;分析判断笔迹是否正常，有无伪装或由于其他原因引起的变化;选择能反映书写人书写习惯的稳定的和带有特殊意义的特征;对检材和样本中找出的特征进行比较，找出符合点和差异点;对符合点和差异点的形成原因综合评断;做出鉴定意见并制做鉴定书。

根据检材笔迹的特点和案情，准确地判断笔迹特征的变化或伪装以及变化或伪装的原因与程度。如检材笔迹熟练程度一致，书写水平与语文水平相适应、运笔自然，笔画间搭配比例协调，书写动作规律性强，既可认定其为正常笔迹。

如检材笔迹的大小与斜度程度不均匀，书写速度不一致，运笔不自然，笔画转折生硬但书写动作有一定体系，相同的单字、笔画特征基本一致，说明它是由于客观原因或出伪装以外的其他主观因素影响形成的变化笔迹。

如检材笔迹熟练程度不一致，书写动作不成系统，笔画弯曲、断续，且有停顿、修描痕迹，字的结构与形态不正常，动作技巧能力与语文水平不相称，一般可判定其为伪装笔迹。

缺席判决只是判决的形式不同，与实际的案件审理情况是没有关系的，都是可以适用于笔迹鉴定的相关情况的，如果对相关情况的处理不清楚的，可以向司法机关咨询，并按照上述规定的程序来进行合法的笔迹鉴定，具体情况结合实际而定。