实施基本药物制度后，城镇职工基本医疗保险基金、城镇居民基本医疗保险基金、新型农村合作医疗基金付费和个人付费，是基层医疗机构提供基本医疗服务所需经费的重要补偿渠道，基层医疗机构将按照政策规定及时足额收取。

　　医疗保险基金筹资的主要来源是财政投入。基本药物实施零差率销售后，在确保达到国家规定的医保待遇水平和基金收入平衡的前提下，将根据基层医疗卫生机构门诊量确定定额或按医疗保险基金付费总额确定一定的比例，从年度医疗保险基金结余中对基层医疗机构进行补偿。