在部分胰岛素依赖型糖尿病人血清中，存在自身抗体及其他抗体。胰岛细胞抗体、胰岛素自身抗体及胰岛B细胞膜上不同分子量抗原（64K、38K）所致抗体等——自身抗体的存在是自身免疫性疾病的标志。在糖尿病临床症状出现之前数年或数月，血清中就可出现自身抗体。胰岛B细胞在自身免疫反应中被细胞毒性T淋巴细胞损伤，在大部分B细胞被破坏后才出现临床症状，这一病变过程可长达数年或短至几天，表现在临床上，胰岛素依赖型糖尿病起病方式有缓慢和急剧的差别。除自身抗体以外，血清中还可发现其他特异性抗体。病毒感染后，病毒作为外来抗原，体内产生相应的特异性病毒抗体。病毒激发的胰岛B细胞自身免疫反应可能与IDDM发病有关。另外，胰岛素制剂，猪胰岛素或牛胰岛素治疗时，这些外源胰岛素对于人体是外来抗原，使体内产生胰岛素抗体。胰岛素抗体的浓度与糖尿病治疗有关。