外科手术治疗感染性心内膜炎的方法包括瓣膜修补和人工瓣膜替代、赘生物摘除同时矫正心血管畸形。适应证包括：膜（主动脉瓣、二尖瓣）严重损毁反流导致顽固性心力衰竭；菌性心内膜炎；③超声心动图显示赘生物大于10mm，有随时可能发生脱落导致栓塞者；④瓣膜置换术后或心内补片感染，经足量抗生素治疗难以控制感染；⑤动脉导管未闭、动静脉瘘或室间隔缺损患者；⑥心肌或瓣环脓肿需手术引流者；⑦大剂量多种广谱抗生素治疗均不敏感者。