贫血是最常见的症状，表现为头晕、乏困、活动后心慌气短等。约20%的患者同时伴有白细胞和血小板的减少。常伴有感染，以泌尿系统感染多见。有的巨幼细胞性贫血患者起病时，以消化系统症状表现明显，容易被误诊。疾病早期以食欲不振多见，并有腹胀、腹泻、便秘。约36%患者常发生口角炎、舌炎，舌面光滑称“镜面舌”或舌质绛红称“牛肉舌”。神经系统以末梢神经炎最常见，严重时会出现精神症状如健忘、易怒、表情呆滞、反应迟钝、目光发直、嗜睡、甚至精神失常。由于营养不良而发生眼睑水肿，下肢凹陷性水肿，严重者出现腹腔积液或多浆膜腔积液。常同时伴有铁缺乏，特别是在有效治疗过程中，耗铁量增多而呈现“混合性贫血”。