在药物中，氯霉素是引起再障的最常见的药物。如果使用氯霉素不当，将会引起再障。一般分为两种，即可逆性红系增生抑制和不可逆性过敏性再障。可逆者是由于氯霉素的毒性所致，与剂量有关。如果使用氯霉素超过一定剂量后，就会发病。因氯霉素结构中的硝基苯根能抑制血细胞线粒体蛋白质的合成，导致线粒体的损坏。由于个体差异，目前尚没有绝对安全的剂量，一般由医生掌握。停药后，病情可以逐渐恢复。不可逆者是由于机体对氯霉素敏感或对其解毒能力有缺陷所致，与剂量无关，而与个体遗传基因异常有关。由于这种人的基因在氯霉素作用下可发生改变，造成骨髓造血多能干细胞不可逆和持久的改变，使其不能分化，结果骨髓三系造血细胞（红系、粒系、巨核细胞）减少，这种病情往往严重。