返流性肾脏病治疗的目的是制止尿液返流和控制感染，防止肾功能的进一步损害。内科治疗对返流性肾脏病有效，尤其是轻度返流而无输尿管扩张者。内科治疗包括：注意个人卫生，摄入充足水分，避免便秘，定期排空膀胱（睡前排尿，以便减轻膀胱内压力及减少残余尿），而最重要的就是长疗程低剂量的抑菌治疗。具体方法为：每晚临睡前排尿后口服一单剂量抗菌药，剂量为每日剂量的1/3～1/2，抗菌药可选用复方新诺明、羟氨苄青霉素、呋喃口旦啶、头孢菌素Ⅳ等。有人认为，将抗生素定期交替使用对防止耐药性有好处。疗程亦未有定论，有学者主张，儿童患者用至青春期或至返流消失后1年，成年病例至少用1年以上。尿路感染可促进肾疤痕形成，如尿路感染发作，应及时积极治疗，以减少肾疤痕形成。对有家族史的婴儿应常规检查有否反流性肾脏病存在，以争取早期治疗。有研究发现，经长疗程低剂量抑菌治疗，随访7～15年，121例返流性肾脏病的2例有新疤痕形成，而另一组报道，间歇短期抗菌治疗，21%病人发生疤痕，66%疤痕发展，故认为，为了防止返流性肾脏病病人肾功能损害的发生及发展，必须坚持长期低剂量抑菌治疗。另外，控制血压是长期治疗的一个重要部分，因高血压可加速病人肾功能的恶化。
　　最近，有作者报道，利用膀胱逼尿肌肌电图测定膀胱逼尿肌的稳定性对选择治疗方案有重要意义，膀胱逼尿肌不稳定收缩的返流病人，即使为重度返流，经抗菌加上抗胆碱药物治疗，返流消失率明显高于对照组。
　　另外，本病可试用中医疗法，我们常用的基本方剂是补阳还五汤（北芪、归尾、赤芍、桃仁、红花、地龙），随症加减化裁。本方能补气活血化瘀通络，通用于气虚血滞、脉络瘀阻的证候。补气佐以活血，使之气足、血行、络通是本方的特点。