特发性甲旁减可能与自身免疫有关，因为患者血中可检测出抗甲状旁腺嗜酸细胞和主细胞的抗体，并可伴有肾上腺皮质、甲状腺或胃壁细胞抗体。还可伴有其他自身免疫病如原发性甲状腺功能减退症、恶性贫血、Addison病等。