抗菌药物生产环节存在的主要问题是同一通用名药物，重复生产厂家太多，质量良莠不齐，生产过程中个别企业疏于质量控制与质量保证。

　　使用中存在的主要问题是：流通环节复杂，招投标使一些质量可靠、价廉的药品淡出竞争圈，部分医药企业采用一些不正当手段促销。社会人群对抗菌药物使用基本知识极度匾乏，经常出现自行购药、自行用药，导致用药剂量不足、疗程过短，感染复发及诱导细菌耐药产生。社会药店的销售人员缺乏药品基本知识，无法真正达到抗菌药物作为处方药物销售的有关要求，不能对患者的用药注意事项及用药教育发挥专业指导作用。同时抗菌药物作为处方药在社会药店的监管也不到位。部分临床医务人员对合理使用抗菌药物知识掌握不足，抗菌药物品种的增多使得临床用药遴选难度增加，在使用过程中屡屡出现不合理用药的现象。临床药师参与抗菌药物合理使用的技术水平尚不能满足临床需求，处方点评中也存在一些专业知识不足的问题，难以协助临床合理用药。

　　抗菌药物在禽类养殖、畜牧业等非医疗行业中的使用，导致细菌耐药的问题，尚未引起国内有关领域的高度重视。