急性非复杂性尿路感染经治疗后90%以上可治愈，而急性复杂性尿感治愈率低，除非纠正了易感因素，否则很难治愈，超过半数于治疗后仍持续有细菌尿或经常复发。复杂性尿路感染可演变为慢性肾盂肾炎，如果延误诊断或治疗不彻底，可导致双侧肾脏疤痕形成，甚至萎缩，形成慢性肾衰竭，最后需要替代治疗以延长存活时间。